《GB5749-2006生活饮用水卫生标准应用指南》共分四章。第一章概论，介绍了我国生活饮用水卫生监督管理、生活饮用水标准发展历程、生活饮用水标准修订背景、新版标准的特点，为读者提供了饮水水质标准的整体概况。第二章标准内容说明，逐条介绍了标准条文内涵、标准指标限值比较、水质指标的分类。第三章指标限值制定依据与说明，详细介绍了106项水质指标的制定依据与卫生学意义。第二章与第三章是应用指南的主要章节，为读者全面释义标准的内容与内涵，以助于读者对标准的理解和掌握。第四章国际饮用水水质标准概况，介绍了世界卫生组织、欧盟和美国的饮用水水质标准的现状、特点与发展趋势，以便于读者了解国际饮用水水质标准的整体概况。
《卫生标准应用指南系列丛书:GB5749-2006生活饮用水卫生标准应用指南》还收录了标准中规范性引用文件涉及的所有标准与文件，以便于读者查阅与使用。《卫生标准应用指南系列丛书:GB5749-2006生活饮用水卫生标准应用指南》可加深读者对标准正文的理解，为该标准的实际应用提供一定的帮助。

第一章 概论
第一节 我国生活饮用水管理概况
第二节 我国饮用水标准的发展历程
第三节 饮用水标准的修订背景和过程
第四节 新版标准的特点

第二章 标准内容说明
第一节 标准条文说明
第二节 标准指标限值比较
第三节 水质指标的分类

第三章 标准指标说明
第一节 微生物指标
第二节 毒理指标
第三节 感官性状和一般化学指标
第四节 放射性指标
第五节 消毒剂指标

第四章 国际饮用水水质标准概况
第一节 世界卫生组织《饮用水水质准则》
第二节 欧盟《饮用水水质指令》
第三节 美国《国家饮用水水质标准》
第四节 国际饮用水水质标准发展趋势

附录
GB 5749—2006 生活饮用水卫生标准
生活饮用水集中式供水单位卫生规范（2001）
GB 17051—1997 二次供水设施卫生规范
GB／T 17218—1998 饮用水化学处理剂卫生安全性评价
GB／T 17219—1998 生活饮用水输配水设备及防护材料的安全性评价标准
GB 3838—2002 地表水环境质量标准
GB／T 14848—1993 地下水质量标准
CJ／T 206—2005 城市供水水质标准
GB／T 5750—2006 生活饮用水标准检验方法（目录）
主要参考文献